弥生会計とfreeeの比較記事はインターネット上に数多く存在しますが、実際に両方を日常業務で使い込んでいる会計事務所の視点から書かれたものは多くありません。

リーパル会計事務所では、顧客企業の状況に応じて弥生・freee双方の導入支援を行っています。本記事では、あくまで現場目線で「どちらが実務に使いやすいか」を正直に評価します。

弥生会計とfreeeの立ち位置

弥生会計

弥生は1994年から日本の中小企業・会計事務所に根付いたソフトウェアブランドです。デスクトップ型の「弥生会計」がスタートで、現在はクラウド型の「弥生会計オンライン」もラインアップしています。「弥生なら安心」という信頼感は、長年の実績に裏打ちされています。

freee

これに対し、freeeは2013年に日本で初めてクラウド会計ソフトを一般向けに提供したパイオニアです。「会計の知識がなくても経理ができる」というコンセプトで、特に個人事業主・フリーランスの間で急速に普及しました。現在は法人向け機能も充実しており、スタートアップから中規模企業まで幅広く利用されています。

機能比較：会計事務所が実際に使った評価

日常の仕訳入力

弥生会計：従来の複式簿記（＝取引を借方・貸方の両面から記録する帳簿方式）に忠実な入力方式。借方・貸方の概念を理解している経理担当者には直感的に操作できます。仕訳日記帳の画面が見やすく、大量の仕訳を効率よく入力できます。

freee：スマート取引取込機能が強力で、銀行明細からの自動仕訳（＝銀行口座やクレジットカードの取引データから勘定科目を自動推定する機能）精度が高い。勘定科目を知らなくても「収入か支出か」「何のための支出か」を選ぶだけで仕訳が完成する設計は、簿記未経験者に優しいです。

会計事務所の視点：複式簿記に慣れたスタッフが大量仕訳を処理するなら弥生、経理初心者が自分で記帳を進めるならfreeeが向いています。

確定申告・決算書の作成

弥生会計：青色申告決算書・法人税申告書類の作成実績が豊富です。e-Tax（＝国税庁が提供する電子申告・納税システム）との連携も安定しており、毎年の申告業務が滞りなく進みます。

freee：確定申告ウィザード機能が特に充実しており、質問に答えるだけで青色申告決算書が完成します。個人事業主が自分で申告する場合の導線設計は、簿記未経験者向けの仕様として完成度の高い水準にあります。

銀行・カード連携

税理士との連携

弥生会計：顧問税理士が弥生ユーザーであれば、同じソフトでのデータ共有ができます。ファイル形式でのやり取りが主流で、クラウド上でのリアルタイム共有には制限があります。

freee：顧問税理士招待機能でリアルタイムにデータを共有できます。リーパル会計事務所では、freeeを使う顧客のデータを常時閲覧できるため、月次確認が月次工数を半分以下に効率化されています。

弥生会計とfreeeの税理士連携について、リーパル会計事務所が実際の運用経験をもとに詳しくご説明します。

料金比較

コスト面では弥生会計オンラインが明確に安いです。特に初年度無料のセルフプランは、コスト重視の事業者には魅力的です。

料金と機能の両面から判断したい場合は、リーパル会計事務所が自社の取引件数と業務範囲に合わせたコスト試算をご提供します。

会計事務所からの正直な評価まとめ

こんな方には弥生、こんな方にはfreee

弥生会計オンラインをおすすめする方

• 長年弥生会計（デスクトップ版）を使ってきた方
• 顧問税理士が弥生ユーザー
• コストを最小限に抑えたい方
• 電話サポートが必要な方

freeeをおすすめする方

• 経理・簿記の知識がほとんどない個人事業主・フリーランス
• 確定申告を初めて自分でやってみたい方
• 税理士とリアルタイムでデータ共有したい方
• スマートフォンでの経費管理を重視する方

リーパル会計事務所のサポート

リーパル会計事務所はfreee認定アドバイザーとして、弥生・freee双方の実務経験を踏まえた最適なソフト選定をサポートします。

月額1万円からの経理BPOパッケージでは、ソフトの選定・初期設定・AI-OCR（＝AIによる文字認識で領収書や請求書をデジタル化する仕組み）活用の自動記帳・月次レビューまで一貫してサポートします。

• 関連記事：弥生会計とfreeeを徹底比較｜機能・料金・使いやすさの違いを解説
• 関連記事：クラウド会計ソフトおすすめ5選｜個人事業主・法人別の選び方

外部参考：freee公式サイト

よくある質問（FAQ）

Q. 弥生会計のデスクトップ版とオンライン版はどちらがよいですか？
クラウド機能・複数人アクセス・法改正自動対応を重視するならオンライン版が現代のニーズに合っています。デスクトップ版は過去データ管理目的での継続利用が多い状況です。

Q. freeeから弥生へ切り替えることはできますか？
技術的には可能ですが、データ形式の変換が必要です。年度末での切り替えを推奨します。リーパル会計事務所では移行支援も承っています。

Q. 個人事業主として弥生かfreeeか迷っています。どちらを選べばよいですか？
確定申告を自分でやりたい・経理の知識があまりないならfreeeをおすすめします。コストを抑えてシンプルに帳簿管理をしたいなら弥生のセルフプランも選択肢です。

Q. 弥生会計オンラインの初年度無料期間終了後はどうなりますか？
自動的に有料プランへ移行するか、解約してデータをエクスポートする選択になります。事前に通知があるため、更新タイミングで改めて選択できます。

Q. どちらもMacに対応していますか？
freeeとマネーフォワードクラウドはクラウドネイティブのためMac・Windows・スマートフォンいずれも対応。弥生会計オンラインもブラウザアクセスのため基本的にMacで利用可能です。

まとめ

弥生会計とfreeeは設計思想が大きく異なるソフトです。会計事務所の現場感覚では「安定性・コスト・既存ユーザーの継続性」を重視するなら弥生会計、「自動化・簿記未経験者対応・税理士とのリアルタイム共有」を重視するならfreee、という棲み分けが定着しています。両ソフトを実務で使い込んできた立場からも、双方とも代替不可能な強みを持っています。

リーパル会計事務所はfreee・MFクラウドの認定アドバイザーとして、弥生からの移行プロジェクトもこれまで多数支援してきました。「弥生をしばらく続けるか乗り換えるか迷っている」「移行コストとメリットを比較したい」という法人様は、初回無料相談からお声がけください。

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監修：鳥羽 卓朗（公認会計士・税理士）
リーパル会計事務所 代表。クラウド会計支援1,000社超。freee認定アドバイザー。

最終更新日：2026年4月21日

参考資料

• freee公式サイト